时序分类模块使用教程¶
一、概述¶
时序分类是通过分析数据随时间变化的趋势、周期性、季节性等因素,来识别并分类不同的时间序列模式,专门用于处理和分析时间序列数据。这种技术广泛应用于医疗诊断等领域,能够有效分类时间序列中的关键信息,为决策提供有力支持。
二、支持模型列表¶
模型名称 | 模型下载链接 | acc(%) | 模型存储大小(M) | 介绍 |
---|---|---|---|---|
TimesNet_cls | 推理模型/训练模型 | 87.5 | 792K | 通过多周期分析,TimesNet是适应性强的高精度时序分类模型 |
注:以上精度指标的评估集是 UWaveGestureLibrary。
三、快速集成¶
❗ 在快速集成前,请先安装 PaddleX 的 wheel 包,详细请参考 PaddleX本地安装教程
完成 wheel 包的安装后,几行代码即可完成是时序分类模块的推理,可以任意切换该模块下的模型,您也可以将时序分类的模块中的模型推理集成到您的项目中。运行以下代码前,请您下载示例数据到本地。
from paddlex import create_model
model = create_model("TimesNet_cls")
output = model.predict("ts_cls.csv", batch_size=1)
for res in output:
res.print(json_format=False)
res.save_to_csv("./output/")
四、二次开发¶
如果你追求更高精度的现有模型,可以使用PaddleX的二次开发能力,开发更好的时序分类模型。在使用PaddleX开发时序分类模型之前,请务必安装 PaddleTS 插件,安装过程可以参考PaddleX本地安装教程。
4.1 数据准备¶
在进行模型训练前,需要准备相应任务模块的数据集。PaddleX 针对每一个模块提供了数据校验功能,只有通过数据校验的数据才可以进行模型训练。此外,PaddleX为每一个模块都提供了 Demo 数据集,您可以基于官方提供的 Demo 数据完成后续的开发。若您希望用私有数据集进行后续的模型训练,可以参考PaddleX时序分类任务模块数据标注教程。
4.1.1 Demo 数据下载¶
您可以参考下面的命令将 Demo 数据集下载到指定文件夹:
wget https://paddle-model-ecology.bj.bcebos.com/paddlex/data/ts_classify_examples.tar -P ./dataset
tar -xf ./dataset/ts_classify_examples.tar -C ./dataset/
4.1.2 数据校验¶
一行命令即可完成数据校验:
python main.py -c paddlex/configs/ts_classification/TimesNet_cls.yaml \
-o Global.mode=check_dataset \
-o Global.dataset_dir=./dataset/ts_classify_examples
Check dataset passed !
信息。校验结果文件保存在./output/check_dataset_result.json
,同时相关产出会保存在当前目录的./output/check_dataset
目录下,产出目录中包括示例时序数据和类别分布直方图。
👉 校验结果详情(点击展开)
校验结果文件具体内容为:
{
"done_flag": true,
"check_pass": true,
"attributes": {
"train_samples": 82620,
"train_table": [
[
"Unnamed: 0",
"group_id",
"dim_0",
...,
"dim_60",
"label",
"time"
],
[
0.0,
0.0,
0.000949,
...,
0.12107,
1.0,
0.0
]
],
"val_samples": 83025,
"val_table": [
[
"Unnamed: 0",
"group_id",
"dim_0",
...,
"dim_60",
"label",
"time"
],
[
0.0,
0.0,
0.004578,
...,
0.15728,
1.0,
0.0
]
]
},
"analysis": {
"histogram": "check_dataset/histogram.png"
},
"dataset_path": "./dataset/ts_classify_examples",
"show_type": "csv",
"dataset_type": "TSCLSDataset"
}
上述校验结果中,check_pass
为 True
表示数据集格式符合要求,其他部分指标的说明如下:
attributes.train_samples
:该数据集训练集样本数量为 82620;attributes.val_samples
:该数据集验证集样本数量为 83025;attributes.train_table
:该数据集训练集样本示例数据前10行信息;attributes.val_table
:该数据集训练集样本示例数据前10行信息; 另外,数据集校验还对数据集中所有类别的样本数量分布情况进行了分析,并绘制了分布直方图(histogram.png):
❗注:只有通过数据校验的数据才可以训练和评估。
4.1.3 数据集格式转换/数据集划分(可选)¶
在您完成数据校验之后,可以通过修改配置文件或是追加超参数的方式对数据集的格式进行转换,也可以对数据集的训练/验证比例进行重新划分。
👉 格式转换/数据集划分详情(点击展开)
(1)数据集格式转换
时序分类支持 xlsx 和 xls
格式的数据集转换为 csv
格式。
数据集校验相关的参数可以通过修改配置文件中 CheckDataset
下的字段进行设置,配置文件中部分参数的示例说明如下:
CheckDataset
:convert
:enable
: 是否进行数据集格式转换,支持xlsx和xls
格式的数据集转换为CSV
格式,默认为False
;src_dataset_type
: 如果进行数据集格式转换,无需设置源数据集格式,默认为null
; 则需要修改配置如下:
......
CheckDataset:
......
convert:
enable: True
src_dataset_type: null
......
随后执行命令:
python main.py -c paddlex/configs/ts_classification/TimesNet_cls.yaml \
-o Global.mode=check_dataset \
-o Global.dataset_dir=./dataset/ts_classify_examples
以上参数同样支持通过追加命令行参数的方式进行设置:
python main.py -c paddlex/configs/ts_classification/TimesNet_cls.yaml \
-o Global.mode=check_dataset \
-o Global.dataset_dir=./dataset/ts_classify_examples \
-o CheckDataset.convert.enable=True
(2)数据集划分
数据集校验相关的参数可以通过修改配置文件中 CheckDataset
下的字段进行设置,配置文件中部分参数的示例说明如下:
CheckDataset
:convert
:enable
: 是否进行数据集格式转换,为True
时进行数据集格式转换,默认为False
;src_dataset_type
: 如果进行数据集格式转换,时序分类仅支持将xlsx标注文件转换为csv,无需设置源数据集格式,默认为null
;split
:enable
: 是否进行重新划分数据集,为True
时进行数据集格式转换,默认为False
;train_percent
: 如果重新划分数据集,则需要设置训练集的百分比,类型为0-100之间的任意整数,需要保证与val_percent
的值之和为100;val_percent
: 如果重新划分数据集,则需要设置验证集的百分比,类型为0-100之间的任意整数,需要保证与train_percent
的值之和为100; 例如,您想重新划分数据集为 训练集占比90%、验证集占比10%,则需将配置文件修改为:
......
CheckDataset:
......
split:
enable: True
train_percent: 90
val_percent: 10
......
随后执行命令:
python main.py -c paddlex/configs/ts_classification/TimesNet_cls.yaml \
-o Global.mode=check_dataset \
-o Global.dataset_dir=./dataset/ts_classify_examples
数据划分执行之后,原有标注文件会被在原路径下重命名为 xxx.bak
。
以上参数同样支持通过追加命令行参数的方式进行设置:
python main.py -c paddlex/configs/ts_classification/TimesNet_cls.yaml \
-o Global.mode=check_dataset \
-o Global.dataset_dir=./dataset/ts_classify_examples \
-o CheckDataset.split.enable=True \
-o CheckDataset.split.train_percent=90 \
-o CheckDataset.split.val_percent=10
4.2 模型训练¶
一条命令即可完成模型的训练,此处以时序分类模型(TimesNet_cls)的训练为例:
python main.py -c paddlex/configs/ts_classification/TimesNet_cls.yaml \
-o Global.mode=train \
-o Global.dataset_dir=./dataset/ts_classify_examples
- 指定模型的
.yaml
配置文件路径(此处为TimesNet_cls.yaml
,训练其他模型时,需要的指定相应的配置文件,模型和配置的文件的对应关系,可以查阅PaddleX模型列表(CPU/GPU)) - 指定模式为模型训练:
-o Global.mode=train
- 指定训练数据集路径:
-o Global.dataset_dir
其他相关参数均可通过修改.yaml
配置文件中的Global
和Train
下的字段来进行设置,也可以通过在命令行中追加参数来进行调整。如指定前 2 卡 gpu 训练:-o Global.device=gpu:0,1
;设置训练轮次数为 10:-o Train.epochs_iters=10
。更多可修改的参数及其详细解释,可以查阅模型对应任务模块的配置文件说明PaddleX时序任务模型配置文件参数说明。
👉 更多说明(点击展开)
- 模型训练过程中,PaddleX 会自动保存模型权重文件,默认为
output
,如需指定保存路径,可通过配置文件中-o Global.output
字段进行设置。 - PaddleX 对您屏蔽了动态图权重和静态图权重的概念。在模型训练的过程中,会同时产出动态图和静态图的权重,在模型推理时,默认选择静态图权重推理。
-
在完成模型训练后,所有产出保存在指定的输出目录(默认为
./output/
)下,通常有以下产出: -
train_result.json
:训练结果记录文件,记录了训练任务是否正常完成,以及产出的权重指标、相关文件路径等; train.log
:训练日志文件,记录了训练过程中的模型指标变化、loss 变化等;config.yaml
:训练配置文件,记录了本次训练的超参数的配置;best_accuracy.pdparams.tar
、scaler.pkl
、.checkpoints
、.inference
:模型权重相关文件,包括网络参数、优化器、EMA、静态图网络参数、静态图网络结构等;
4.3 模型评估¶
在完成模型训练后,可以对指定的模型权重文件在验证集上进行评估,验证模型精度。使用 PaddleX 进行模型评估,一条命令即可完成模型的评估:
python main.py -c paddlex/configs/ts_classification/TimesNet_cls.yaml \
-o Global.mode=evaluate \
-o Global.dataset_dir=./dataset/ts_classify_examples
- 指定模型的
.yaml
配置文件路径(此处为TimesNet_cls.yaml
) - 指定模式为模型评估:
-o Global.mode=evaluate
- 指定验证数据集路径:
-o Global.dataset_dir
其他相关参数均可通过修改.yaml
配置文件中的Global
和Evaluate
下的字段来进行设置,详细请参考PaddleX时序任务模型配置文件参数说明。
👉 更多说明(点击展开)
在模型评估时,需要指定模型权重文件路径,每个配置文件中都内置了默认的权重保存路径,如需要改变,只需要通过追加命令行参数的形式进行设置即可,如-o Evaluate.weight_path=./output/best_model/model.pdparams
。
在完成模型评估后,通常有以下产出:
在完成模型评估后,会产出evaluate_result.json,其记录了
评估的结果,具体来说,记录了评估任务是否正常完成,以及模型的评估指标,包含 Acc 和 F1 score。
4.4 模型推理和模型集成¶
在完成模型的训练和评估后,即可使用训练好的模型权重进行推理预测或者进行Python集成。
4.4.1 模型推理¶
通过命令行的方式进行推理预测,只需如下一条命令。运行以下代码前,请您下载示例数据到本地。
python main.py -c paddlex/configs/ts_classification/TimesNet_cls.yaml \
-o Global.mode=predict \
-o Predict.model_dir="./output/inference" \
-o Predict.input="ts_cls.csv"
- 指定模型的
.yaml
配置文件路径(此处为TimesNet_cls.yaml
) - 指定模式为模型推理预测:
-o Global.mode=predict
- 指定模型权重路径:
-o Predict.model_dir="./output/inference"
- 指定输入数据路径:
-o Predict.input="..."
其他相关参数均可通过修改.yaml
配置文件中的Global
和Predict
下的字段来进行设置,详细请参考PaddleX时序任务模型配置文件参数说明。
4.4.2 模型集成¶
模型可以直接集成到PaddleX产线中,也可以直接集成到您自己的项目中。
1.产线集成
时序预测模块可以集成的PaddleX产线有时序分类,只需要替换模型路径即可完成时序预测的模型更新。在产线集成中,你可以使用服务化部署来部署你得到的模型。
2.模块集成
您产出的权重可以直接集成到时序分类模块中,可以参考快速集成的 Python 示例代码,只需要将模型替换为你训练的到的模型路径即可。